若果智慧齒已經造成蛀牙、或有牙周發炎的狀況，表示智慧齒的清潔不徹底, 這可能是因為它的位置太後難以清潔，那就會建議拔除；因為即使勉強填補，還是不容易清潔，以至於很快會再度造成蛀牙。如果智慧齒長得不正，往前後左右傾斜，甚至埋伏長不出來；這樣的牙齒很容易藏有污垢，導致牙齒周圍的牙齦發炎腫痛，也同樣建議拔除。 如果上下顎智慧齒中有一顆已經缺了， 也會建議對側的智慧齒可以拔掉，免得這顆牙齒一直往另一方向生長，可能造成咬合干擾。相反地，若是智慧齒長得很正，清潔方面也沒有問題，就會建議保留。